EMBOSS序列分析软件包安装

安装步骤

1. 在用户家目录下创建子目录tool，进入子目录tool, 创建二级子目录emboss，进入二级子目录emboss
2. 从教学服务器归档文件EMBOSS-6.6.0.tar中提取源程序，生成安装目录EMBOSS-6.6.0
   tar -xvf /rd1/leb26/tool/EMBOSS-6.6.0.tar
   -x 表示Extract（提取）
   -v 表示Verbose（显示详细信息）
   -f 表示File（文件名）
3. 进入安装目录EMBOSS-6.6.0，用以下命令安装到用户家目录下tool/emboss子目录中
   ./configure --prefix=/rd1/home/用户账号/tool/emboss 用户账号如leb26g01a
   make
   make install
   
4. 在用户家目录下创建子目录bin，进入bin子目录，创建刚安装的EMBOSS可执行程序链接
   cd ~
   mkdir bin
   ln -s ~/tool/emboss/bin/* ~/bin/
5. 激活用户~/bin/目录：
   source ~/.profile

测试和使用

1. 进入EMBOSS工作目录，测试是否调用刚安装而非系统安装的EMBOSS版本
   which needle
   屏幕显示/rd1/home/用户账号/bin/needle 用户账号如leb26g01a
2. 查看系统安装的Needle程序
   whereis needle
   屏幕显示：/usr/local/bin/needle /rd1/home/用户账号/bin/needle 用户账号如leb26g01a
3. 执行系统安装的程序Needle
   /usr/local/bin/needle