BLAST数据库搜索系统

简介

1. 名称：基于序列局部相似性的数据库搜索系统Basic Local Alignment Search Tool (BLAST）
2. 下载地址：美国国家生物技术信息中心 NCBI

通用程序

1. BlastP: 用蛋白质序列搜索蛋白质序列数据库
1. PSI-BLAST: 位点特异性迭代BLAST (Position-specific iterated BLAST)
2. DELTA-BLAST: 基于保守结构域的快速搜索(Domain Enhanced Lookup Time Accelarated BLAST)
3. PHI-BLAST: 基于序列模体的数据库搜索(Pattern Hit Initiated BLAST)
2. BlastN: 用核酸序列搜索核酸序列数据库
3. BlastX: 将核酸序列按6条读码框翻译成蛋白质序列后搜索蛋白质序列数据库
4. tBlastN: 将核酸序列数据库中的序列按6条读码框翻译成蛋白质序列，用蛋白质序列搜索翻译后得到的蛋白质序列

专用程序

1. SmartBlast 搜索模式生物蛋白质序列数据库
2. PrimerBlast 引物设计
3. CD Search 搜索蛋白质保守结构域数据库
4. IgBlast 搜索免疫球蛋白家族数据库
5. VecScreen 搜索载体序列片段
6. COBALT 多序列比对