Linux-based Essential Bioinformatics

Linux生物信息技术基础
2026-05-26更新
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BLAST安装、配置


安装

  1. 教学服务器已下载压缩包:/rd1/home/public/BLAST/BLAST_TOOL/ncbi-blast-2.16.0+-x64-linux.tar.gz
  2. 在本人家目录下创建安装目录
    mkdir ~/install/
    mkdir ~/install/blast
  3. 在安装目录~/install/blast下打开归档文件
    cd ~/install/blast
    tar -zxvf /rd1/home/public/BLAST/BLAST_TOOL/ncbi-blast-2.16.0+-x64-linux.tar.gz
  4. 参数-z表示解压gzip
    参数-x表示提取Extract
    参数-v表示显示提取信息Verbose
    参数-f表示文件File

配置

  1. 修改用户家目录下隐藏文件~/.profile, 增加BLAST环境变量设置信息:
    if [ -d "$HOME/install/blast/ncbi-blast-2.16.0+/bin/" ]; then
    PATH="$HOME/install/blast/ncbi-blast-2.16.0+/bin/:$PATH"
    fi
  2. 激活环境变量设置文件
    source ~/.profile
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