Linux-based Essential Bioinformatics

Linux生物信息技术基础
2026-05-26更新
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vim编辑系统实例


实例6 — 37个珠蛋白数据集

  1. 下载人、小鼠、大鼠37个珠蛋白编码基因FASTA格式序列 37GLOBIN_CDS.FAS
  2. 提取注释信息,保存到文本文档37globin,用Vim编辑系统删除第一列">"符号
  3. 用Vim编辑系统或head/tail命令将37globin拆分成三组数据:人13个(Human)、小鼠13个(Mouse)、大鼠11个(Rat)
  4. 用Vim编辑系统删除三个数据集中物种名Hs/Mm/Rn,用s/[a-z]/\U&/g将小鼠和大鼠数据集中小写字母替换成大写
  5. 将上述三个数据集下载到本地,用TBtools绘制维恩图Venn Diagram
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