实例2：976个脊椎动物珠蛋白

研究背景

1. UniProt/Swiss-Prot蛋白质序列数据库中收录了976个人工注释的脊椎动物珠蛋白基因家族蛋白质序列注释信息
2. 利用MySQL数据库系统构建数据库，按不同条件进行数据查询，掌握数据库系统基本用法

创建数据表

1. 从公共目录中复制脊椎动物珠蛋数据/rd1/home/public/mysql/976globin
   数据格式：编号、登录号、序列名、基因名、蛋白名、分类号、物种名、序列长度、收录日期
   
2. 创建数据表
   CREATE TABLE 数据表名 ( num INT AUTO_INCREMENT PRIMARY KEY,
   acc CHAR(8),
   ent CHAR(12),
   gen CHAR(10),
   pro CHAR(20),
   tax CHAR(8),
   spe VARCHAR(40),
   len SMALLINT,
   dat DATE );
   
3. 导入数据:
   LOAD DATA LOCAL INFILE '976globin' INTO TABLE 976globin;

数据查询

1. 查看表格976globin列名
   DESCRIBE 976globin;
2. 查看前10个序列
   SELECT * FROM 976globin LIMIT 10;
3. 删除第1行中文列名信息
   DELETE FROM 976globin WHERE num=1;
4. 找出长度超过1000的序列
   SELECT * FROM 976globin WHERE len>1000;
5. 找出122个基因名为MB/mb且序列长度不小于146的全长肌红蛋白
   SELECT * FROM 976globin WHERE gen='MB' AND len>=146;
6. 查看13个人的珠蛋白
   SElect * FROM 976globin WHERE tax='9606';
7. 找出39个Gamma珠蛋白，包括Gamma-1, Gamma-2
   SELECT * FROM 976globin WHERE pro LIKE 'Gamma%';
8. 查看1986年Swiss-Prot创建时收录的数据
   SELECT * FROM 976globin WHERE dat LIKE '1986%';
9. 按序列长度从小到大查看前10行信息
   SELECT * FROM 976globin ORDER BY len LIMIT 10;

数据修改

1. 查看UniProt序列长度和收录历史(History)信息，修改以下10个序列条目错误信息：
   HBA_PIG, HBA_RAT, HBB_PIG, HBB_RAT, HBE_PIG, HBAZ_HUMAN, MYG_PIG, MYG_RAT, NGB_PIG, NGB_RAT
2. 将HBA_PIG分类号改为9823
   UPDATE 976globin SET tax='9823' WHERE ent='HBA_PIG';
3. 将HBA_PIG序列长度改为141
   UPDATE FROM 976globin SET len=141 WHERE ent='HBA_PIG';
   
4. 将HBA_PIG分类号改为9823
   UPDATE FROM 976globin SET tax=’9823‘ WHERE ent='HBA_PIG';
   UPDATE FROM 976globin SET dat='1988-11-01' WHERE ent='HBA_PIG';
   
5. 将HBA_PIG收录日期改为1998-11-01
   UPDATE FROM 976globin SET dat='1988-11-01' WHERE ent='HBA_PIG';