Linux-based Essential Bioinformatics
Linux生物信息技术基础
2026-05-26更新
网络数据库
基本方法
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利用HTML和PHP网络编程技术,可以将MySQL数据库中的信息在网页上展示
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可以利用VSCode等工具编写HTML和PHP代码
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利用MobaXterm等工具,将上述代码上传到教学服务器家目录下本人账号子目录中,如g01a
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在浏览器下查看所构建的数据库,如
G01A
实例 — 脊椎动物珠蛋白数据库VGDB
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参阅MySQL实例,创建脊椎动物976个珠蛋白数据表
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参阅本课程MySQL实例976个脊椎动物珠蛋白,修改数据表中错误信息
976Globin
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补全该数据表中部分序列条目基因名
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修改补全后的数据可从教学服务器公共目录复制/mysql/976globin.new
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进入MySQL系统,删除原数据表976globin中所有数据,将修改后的新数据导入数据表976globin
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检查新数据表中的数据是否准确,特别时猪(Pig)和小鼠(Rat)的数据
SELECT * FROM 976globin WHERE ent LIKE "%_PIG";
SELECT * FROM 976globin WHERE ent LIKE "%_RAT";
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以976globin为例,构建基于浏览器的脊椎动物珠蛋白数据库:
VGDB